Yggdrasil es un personaje ficticio de la franquicia Digimon, basado en el árbol de la vida de la mitología Nórdica. Su primera aparición fue en el argumento escrito para la quinta generación de V-Pets de Digimon y para el juego de cartas, aunque esta aparición ha sido menos importante que en sus apariciones en el anime. Ha hecho aparición como un personaje clave en Digital Monster X-Evolution y en Digimon Savers, y en el manga ha hecho aparición en Digimon Next.

En las continuidades en las que ha aparecido, Yggdrasil siempre ha sido mostrado como el "Dios" del Digimundo (デジタルワールドの神 Dejitaru Waarudo no Kami), el hogar de los Digimon. Yggdrasil vigila la supervivencia de este mundo, y en casos críticos, decreta su destrucción. Aunque en el perfil de los V-Pets, Yggdrasil es llamado "La Computadora de Control del Digimundo", sus apariciones en el anime lo muestran como algo más ambiguo.

En todas las continuidades en las que ha aparecido, Yggdrasil ha tenido un control total sobre los Caballeros Reales.

En esta película, Yggdrasil es la Computadora Central que mantiene al Digimundo y se encuentra ubicada en el espacio exterior. Su verdadera forma es orbe ubicado sobre un pedestal que se encuentra dentro del núcleo de la Computadora Central.

En los eventos que ocurren antes de la película, Yggdrasil desencadeno una serie de sucesos que terminaron con la destrucción del Digimundo y la creación de un nuevo Digimundo, donde solo los Digimon escogidos directamente por Yggdrasil para sobrevivir podían habitarlo. Sin embargo, la misteriosa aparición de los Digimon X puso en riesgo los planes de Yggdrasil. Esto lo forzó a enviar a los Caballeros Reales a destruir tanto a los Digimon escogidos como a los Digimon X.

Usando los datos de Dorumon, un Digimon creado por los experimentos de Yggdrasil y dejado en libertad en el Digimundo, Yggdrasil creo una armada de Death-X-Dorugremon, enviándolos a destruir el Digimundo. Mientras Dukemon se mostraba reticente a seguir las órdenes de su señor, Omegamon y Magnamon lealmente siguieron las órdenes de su Dios.

Cuando Dorumon revela su identidad como Alphamon, el líder de los Caballeros Reales, Omegamon decide traicionar a Yggdrasil. En la última batalla, cuando Alphamon se da cuenta de que Death-X-mon es su propia sombra, decide sacrificase, empalándose a si mismo con su espada, dañando en el proceso a Yggdrasil. Antes de fundirse con Death-X-mon y volver a ser Dorumon, Alphamon le entrega parte de su Anticuerpo X a Omegamon, haciendo que este evolucione en Omegamon X, quien usa su nuevo poder para destruir a Yggdrasil, logrando que el Digimundo pudiera renacer.

Luego, Omegamon y Dukemon especulan acerca de las verdaderas intenciones de Yggdrasil. Aunque las razones son aun desconocidas, Dukemon llega a la conclusión de Yggdrasil actuó por desesperación.

En Savers, la forma de Yggdrasil es muy ambigua. En un principio, no posee forma física, pero se representa a si mismo por cristales de luz, los cuales poseen su esencia y pueden manifestar su poder. Vive en un gran fresno, que representa al árbol de la vida.

Yggdrasil es nombrado por primera vez durante la saga de Mercurimon. Diez años antes de los eventos ocurridos en la serie, Mercurimon le contaría a Daimon Suguru acerca de la existencia de este, un Dios que gobernaba todo el Digimundo. Suguru parte en busca de Yggdrasil, y diez años después, con la ayuda de Banchou Leomon, logra encontrarlo. Desgraciadamente, debido a la muerte de Mercurimon a manos de Kurata y las acciones que este cometería contra el Digimundo posteriormente, Suguru es apresado por los Caballeros Reales y condenado a muerte.

Sin embargo, Banchou Leomon logra escapar, llevándose el alma de Suguru dentro de su cuerpo. Yggdrasil entonces, decide poseer el cuerpo de Suguru, y da la orden a sus Caballeros de destruir el Mundo Real.

Durante la batalla final, Banchou Leomon se sacrifica para destruir a Yggdrasil, en vano, ya que una vez destruido el cuerpo de Suguru, Yggdrasil reaparece como un gigantesco robot que se llama a si mismo WIZ9000 Computer (o Yggdrasil 7_D6, como es llamado en el Juego de cartas), y cuya misión es monitorear el avance de las formas de vida digitales. Con sus nuevos poderes es capaz derrotar a los Digimon de los protagonistas, incluyendo las evoluciones más poderosas. Sin embargo, los Caballeros Reales aparecen y desafían a Yggdrasil, pues comienzan a dudar de sus intenciones. Yggdrasil no duda en atacar a sus Caballeros.

Cuando parecía que todo estaba perdido, el Digisoul de los humanos y los Digimon resplandece al mismo tiempo. Usando el Digisoul de Masaru, Agumon evoluciona en Burst Mode, y logra destruir el cuerpo robótico de Yggdrasil. Dentro, Masaru y Agumon encuentran su verdadera forma: una estatua de apariencia femenina. Masaru la ataca, destruyéndola con su puño. Entonces, la esencia de Yggdrasil, nuevamente en forma de cristal es revelada. Yggdrasil no desea más destruir el mundo humano, y retorna al Digimundo, sellando la fisura entre ambos mundos, y entrando en un estado de hibernación, mientras espera "ver como serán las cosas de ahora en adelante".

En Digimon Next, Yggdrasil tiene la misma apariencia robotica del Yggdrasil al final de Savers. Su función en el manga es la misma que en sus anteriores encarnaciones, aunque en el manga, Yggdrasil reside en el Mundo del Sistema, y no parece tener control sobre los Caballeros Reales (o al parecer ellos no existen en esta realidad).

Para investigar las relaciones entre los humanos y los Digimon, Yggdrasil hace que su consciencia tome forma humana, bajo la apariencia de una niña llamada Mikihara Norn, la cual fue enviada al Mundo Real, y eventualmente hará amistad con Tsurugi, Shou y los demás protagonistas del Manga.

Sin embargo, Barbamon invadió el Mundo del Sistema y aprovecho que la consciencia de Yggdrasil estaba fuera para tomar el control del mundo Digital fusionándose forzosamente con su cuerpo. Para evitar cualquier problema, Barbamon captura a Norn, a la cual mantiene como rehén en su Castillo. Sin embargo, Yggdrasil ya tenia previsto una calamidad como esa, y creo los Digimon Twin como arma secreta.